ไฟล์ที่มีนามสกุลไฟล์ PDB เป็นไฟล์ที่สร้างขึ้นในรูปแบบฐานข้อมูลของโปรแกรมซึ่งใช้เพื่อเก็บข้อมูลดีบักเกี่ยวกับโปรแกรมหรือโมดูลเช่นไฟล์ DLL หรือ EXE บางครั้งเรียกว่าไฟล์สัญลักษณ์
ไฟล์ PDB จะแม็พส่วนประกอบและข้อความต่างๆในซอร์สโค้ดกับผลิตภัณฑ์ที่คอมไพล์ขั้นสุดท้ายซึ่งดีบั๊กสามารถใช้เพื่อค้นหาไฟล์ต้นฉบับและตำแหน่งในปฏิบัติการที่จะหยุดกระบวนการดีบั๊ก
ไฟล์ PDB บางไฟล์อาจอยู่ในรูปแบบไฟล์ข้อมูล Protein Bank ไฟล์ PDB เหล่านี้เป็นไฟล์ข้อความธรรมดาที่เก็บพิกัดเกี่ยวกับโครงสร้างโปรตีน
ไฟล์ PDB อื่นอาจถูกสร้างขึ้นในรูปแบบไฟล์ Palm Database หรือ PalmDOC และใช้กับระบบปฏิบัติการ PalmOS mobile ไฟล์บางไฟล์ในรูปแบบนี้ใช้นามสกุล. PRC แทน
วิธีการเปิดไฟล์ PDB
โปรแกรมต่างๆใช้ไฟล์ PDB ของตนเองเพื่อจัดเก็บข้อมูลในรูปแบบฐานข้อมูลที่มีโครงสร้างเพื่อให้แต่ละแอปพลิเคชันใช้เพื่อเปิดไฟล์ PDB ของตนเอง Geneious, Intuit Quicken, Microsoft Visual Studio และ Pegasus เป็นเพียงตัวอย่างบางส่วนของโปรแกรมที่อาจใช้ไฟล์ PDB เป็นไฟล์ฐานข้อมูล Radare และ PDBparse อาจทำงานเพื่อเปิดไฟล์ PDB ด้วย
ไฟล์ PDB บางไฟล์จะถูกจัดเก็บเป็นข้อความล้วนเช่นไฟล์ฐานข้อมูลดีบั๊กของ Geneious 'Debug Database' และสามารถอ่านได้โดยมนุษย์หากเปิดในโปรแกรมแก้ไขข้อความ คุณสามารถเปิดไฟล์ PDB ชนิดนี้ได้โดยใช้โปรแกรมใด ๆ ที่สามารถอ่านเอกสารข้อความได้เช่นโปรแกรม Notepad ในตัวใน Windows ผู้ดูและบรรณาธิการไฟล์ PDB อื่น ๆ ได้แก่ Notepad ++ และ Brackets
ไฟล์ฐานข้อมูล PDB อื่น ๆ ไม่ใช่เอกสารข้อความและมีประโยชน์เฉพาะเมื่อเปิดด้วยโปรแกรมที่มีไว้สำหรับ ตัวอย่างเช่นหากไฟล์ PDB ของคุณเกี่ยวข้องกับ Quicken บางวิธีลองใช้ซอฟต์แวร์ดังกล่าวเพื่อดูหรือแก้ไขไฟล์ PDB Visual Studio คาดว่าจะเห็นไฟล์ PDB ในโฟลเดอร์เดียวกับไฟล์ DLL หรือ EXE
คุณสามารถดูและแก้ไขไฟล์ PDB ที่เป็นไฟล์ Protein Data Bank ใน Windows Linux และ macOS กับ Avogadro Jmol, RasMol, QuickPDB และ USCF Chimera สามารถเปิดไฟล์ PDB ด้วย เนื่องจากไฟล์เหล่านี้เป็นข้อความล้วนคุณจึงสามารถเปิดไฟล์ PDB ในโปรแกรมแก้ไขข้อความได้
Palm Desktop ควรสามารถเปิดไฟล์ PDB ที่อยู่ในรูปแบบไฟล์ฐานข้อมูล Palm Database แต่คุณอาจต้องเปลี่ยนชื่อไฟล์เป็นครั้งแรกเพื่อให้ได้นามสกุลไฟล์. PRC สำหรับโปรแกรมดังกล่าวเพื่อจดจำไฟล์ดังกล่าว หากต้องการเปิดไฟล์ PalmDOC PDB ลองใช้ STDU Viewer
วิธีแปลงไฟล์ PDB
ไฟล์ฐานข้อมูลของโปรแกรมอาจไม่ได้รับการแปลงเป็นรูปแบบไฟล์อื่นอย่างน้อยไม่ใช่เครื่องมือแปลงไฟล์ทั่วไป แต่ถ้ามีเครื่องมือใด ๆ ที่สามารถแปลงไฟล์ PDB แบบนี้ได้จะเป็นโปรแกรมเดียวกับที่สามารถเปิดได้
ตัวอย่างเช่นถ้าคุณต้องการแปลงไฟล์ฐานข้อมูล PDB จาก Quicken ให้ลองใช้โปรแกรมที่จะทำ การแปลงประเภทนี้อาจใช้ไม่ได้เพียงเล็กน้อย แต่ยังไม่ได้รับการสนับสนุนในแอ็พพลิเคชันฐานข้อมูลเหล่านี้ (นั่นคือคุณอาจไม่จำเป็นต้องแปลงไฟล์ PDB นี้เป็นรูปแบบอื่น)
แฟ้มข้อมูล Protein Data Bank สามารถแปลงเป็นรูปแบบอื่น ๆ ได้ด้วย MeshLab เมื่อต้องการทำเช่นนี้คุณอาจต้องแปลงไฟล์ PDB เป็น WRL ก่อนด้วย PyMOL จากไฟล์ ไฟล์> บันทึกภาพเป็น> VRML เมนูแล้วนำเข้าไฟล์ WRL ใน MeshLab และใช้ ไฟล์> ส่งออกตาข่ายเป็น เพื่อแปลงไฟล์ PDB เป็นไฟล์ STL หรือไฟล์รูปแบบอื่น
หากคุณไม่ต้องการให้เป็นแบบสีคุณสามารถส่งออกไฟล์ PDB ไปยัง STL โดยตรงกับ USCF Chimera (ลิงก์ดาวน์โหลดอยู่ด้านบน) มิเช่นนั้นคุณสามารถใช้วิธีเดียวกับข้างต้น (กับ MeshLab) เพื่อแปลง PDB เป็น WRL กับ USCF Chimera แล้วส่งออกไฟล์ WRL เป็น STL ด้วย MeshLab
หากต้องการแปลง PDB เป็น PDF หรือ EPUB หากคุณมีไฟล์ PalmDOC สามารถทำได้หลายวิธี แต่วิธีที่ง่ายที่สุดน่าจะเป็นไปได้ที่จะใช้ตัวแปลง PDB แบบออนไลน์เช่น Zamzar คุณสามารถอัปโหลดไฟล์ PDB ของคุณไปยังเว็บไซต์ดังกล่าวเพื่อให้สามารถแปลงเป็นรูปแบบเหล่านั้นรวมทั้ง AZW3, FB2, MOBI, PML, PRC, TXT และรูปแบบไฟล์ eBook อื่น ๆ
ในการแปลงไฟล์ PDB เป็นรูปแบบ FASTA สามารถทำได้ด้วย PDB แบบออนไลน์ของ Meiler Lab เพื่อแปลง FASTA
นอกจากนี้ยังสามารถแปลง PDB เป็น CIF (รูปแบบข้อมูลการตรวจจับข้อมูลทางวิทยาศาสตร์) โดยใช้ PDBx / mmCIF
การอ่านขั้นสูงเกี่ยวกับไฟล์ PDB
คุณสามารถอ่านไฟล์โปรแกรมฐานข้อมูลจาก Microsoft, GitHub และ Wintellect ได้มากขึ้น
มีข้อมูลเพิ่มเติมเกี่ยวกับไฟล์ Protein Data Bank ด้วย ดูที่ธนาคารข้อมูลโปรตีนทั่วโลกและ RCB PDB
ไฟล์ของคุณยังไม่เปิด?
PDB ไฟล์ที่ไม่ได้เปิดด้วยเครื่องมือใด ๆ จากข้างต้นอาจจะไม่ได้เป็นไฟล์ PDB จริง สิ่งที่อาจเกิดขึ้นคือคุณเข้าใจผิดนามสกุลไฟล์ บางรูปแบบไฟล์ใช้คำต่อท้ายที่ใกล้เคียงกับ ".PDB" เมื่อพวกเขาไม่เกี่ยวข้องจริงๆและไม่ทำงานเหมือนกัน
ตัวอย่างเช่นไฟล์ PDF เป็นไฟล์เอกสาร แต่โปรแกรมส่วนใหญ่จากด้านบนจะไม่แสดงข้อความและ / หรือภาพอย่างถูกต้องหากคุณพยายามเปิดไฟล์ด้วยโปรแกรมเหล่านี้ เช่นเดียวกับไฟล์อื่นที่มีนามสกุลไฟล์ที่สะกดเหมือนกันเช่น PD, PDE, PDC และ PDO
PBD เป็นอีกหนึ่งโปรแกรมที่อยู่ในโปรแกรม EaseUS Todo Backup และมีประโยชน์เฉพาะเมื่อเปิดขึ้นด้วยซอฟต์แวร์ดังกล่าว
หากคุณไม่มีไฟล์ PDB ให้ตรวจดูส่วนขยายไฟล์ที่ไฟล์ของคุณมีเพื่อให้คุณสามารถหาโปรแกรมที่เหมาะสมซึ่งจะเปิดหรือแปลงไฟล์นั้น
